Desarrollo de Tecnología de la Web Semántica Aplicada a la Biología de Sistemas

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ASBP: Applied Systems Biology Project
Este proyecto se plantea el desarrollo de herramientas para facilitar el desarrollo de aplicaciones en la Web Semántica y su aplicación a problemas reales en el campo de la Biología de Sistemas. Estas herramientas incluirán herramientas de alineamiento de ontologías, servicios de razonamiento, localización de recursos semánticos y gestión de metadatos, aplicándose en el dominio de la Biología de Sistemas.
Recursos: 
Protopia
KOMF
AMMO-Prot
SBMM
VSB
Líneas de investigación: 
Aplicaciones: Biología de sistemas, Web semántica para e-Ciencia.
Investigador principal: 
José F. Aldana Montes
Francisca Sánchez-Jiménez
Miembros: 
José F. Aldana Montes
Ismael Navas Delgado
Antonio César Gómez Lora
María del Mar Roldán García
Jorge Martínez Gil
Amine Kerzazi
Othmane Chniber
David Urdiales Nieto
Joaquín Jorge Molina Castro
Daniel Pastor de la Rubia
María Jesús García Godoy
Estado: 
Proyecto Finalizado
Financiación: 
Pública
Fecha de inicio: 
01/2006
Fecha de fin: 
12/2008
Ámbito: 
Regional
Referencia: 
P07-TIC-02978
Publicaciones: 
Evaluation of two Heuristic Approaches to Solve the Ontology Meta-Matching problem.
Social pathway annotation: extensions of the systems biology metabolic modelling assistant.
KA-SB: from data integration to large scale reasoning
An Overview of Current Ontology Meta-Matching Solutions
DBTech EXT: Education and Hands-On Training for the Database Professional.
A Data Warehouse Approach to Semantic Integration of Pseudomonas Data.
Statistical Study about Existing OWL Ontologies from a Significant Sample as Previous Step for their Alignment.
Protopia: a protein-protein interaction tool.
Extending SD-Core for Ontology-based Data Integration
Systems biology metabolic modeling assistant: an ontology-based tool for the integration of metabolic data in kinetic modeling.
Towards a Scalable Infrastructure for Semantic Web Services Execution.
Data integration: introducing semantics
Innovative unity in the diversity of information management skills teaching and training across europe
Semantic Fields: Finding Ontology Relationships.
Complete OWL-DL Reasoning Using Relational Databases.
Boosting Annotated Web Services in SAWSDL.
Structural kinetic modeling of polyamine metabolism in mammals
MaSiMe: A Customized Similarity Measure and Its Application for Tag Cloud Refactoring.
Un Editor de Modelos OWL-S: OWL-S Modeller
Una propuesta para la anotación semiautomática de servicios web usando SAWSDL.
Semantic ESB: a scalable platform for semantic web services execution
The Amine system project: systems biology in practice.
Comparison of textual renderings of ontologies for improving their alignment.
AMMO-Prot: amine system project 3D-model finder.
ECQ: a simple query language for the semantic web.
DBOWL: towards a scalable and persistent OWL reasoner.
SD-Core: generic semantic middleware components for the semantic web.
VSB: the visual semantic browser.
SD-Core: A Semantic Middleware Applied to Molecular Biology.
Optimizing ontology alignments by using genetic algorithms.
Extending ESB for Semantic Web Services Understanding.
A Semantic Mediation Architecture for RDF Data Integration
A Protégé plugin for storing owl ontologies in relational databases.
Comparación de fuentes de conocimiento web para su empleo en el matching de ontologías.
Bioqueries: A Social Community Sharing Experiences while Querying Biological Linked Data
SB-KOM: Integration of Pathway Information with BioPax
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